青木 志穂 Shiho Aoki B.Sc.

一貫制博士2年（修士2年相当）

先進理工学専攻 （5年一貫制博士課程）12期生

中谷医工計測技術振興財団 大学院生奨学金 7期生（2023年~2028年）

【研究開発支援制度】
サイボウズ・ラボユース第13期 研究生（2023年度）
サイボウズ・ラボユース第13期 ユース生（2024年度）

mail

k1973olly@akane.waseda.jp

GitHub: @shiho-aoki

学歴

2019年 早稲田大学本庄高等学院　卒業
2019年 早稲田大学先進理工学部生命医科学科　入学
2023年 早稲田大学先進理工学部生命医科学科　卒業
2023年 早稲田大学院先進理工学研究科 先進理工学専攻　入学

所属グループ

生物班

研究テーマ

E3ユビキチンリガーゼPraja Familyを通したタウタンパク質の品質管理・分子病態制御

研究キーワード

分子進化, E3ユビキチンリガーゼ, アルツハイマー病, 分子動力学シミュレーション（MD）, 量子アニーリング

所属学会

日本分子生物学会, 日本生物物理学会, 日本蛋白質科学会, 生化学会

論文

[4] E3 ligase Praja1 mediates ubiquitination and degradation of microtubule-associated protein Tau,
Shiho Aoki, Kotaro Kawasaki, Kazuki Imadegawa, Mizuho Oishi, Toru Asahi, Wataru Onodera, bioRxiv. (2024).


[3] Functional Divergence and Origin of the Vertebrate Praja Family,
Wataru Onodera, Kotaro Kawasaki, Mizuho Oishi, Shiho Aoki, Toru Asahi, J Mol Evol. (2024).

[2] Data on the solution and processing time reached when constructing a phylogenetic tree using a quantum-inspired computer,
Wataru Onodera, Nobuyuki Hara, Shiho Aoki, Toru Asahi, Naoya Sawamura, Data in Brief, 47, 108970 (2023).

[1] Phylogenetic tree reconstruction via graph cut presented using a quantum-inspired computer,
Wataru Onodera, Nobuyuki Hara, Shiho Aoki, Toru Asahi, Naoya Sawamura, MOL PHYLOGENET EVOL., 178, (2023).

研究費

学会発表

【国内学会発表】
〇Shiho Aoki, Toru Asahi, Wataru Onodera,
【ポスター】'Comprehensive Analysis of the Properties and Functions of Intrinsically Disordered Proteins (IDP) by Integrated Database Profiling', 第24回日本蛋白質科学会, 1P-067, 2024/06/11

〇Shiho Aoki, Wataru Onodera, Toru Asahi,
【ポスター】'Functional analysis of a low-complexity region specific to the primate E3 ubiquitin ligase Praja1.', The 46th Annual Meeting of the Molecular Biology Society of Japan (MBSJ2023),1P-334, 2023/12/06

〇Shiho Aoki, Wararu Mori, Toru Asahi, Wataru Onodera,
【ポスター】'Analysis of a low-complexity region, a naturally degenerate region specific to the primate E3 ubiquitin ligase Praja1.' Supercomputer Workshop 2023, P-2, 2024/01/15

【国際学会発表】
〇Shiho Aoki, Toru Asahi, Wataru Onodera,
【ポスター】'Comprehensive Analysis of Intrinsically Disordered Proteins in the Marsupial.' 21st IUPAB & 62nd BSJ Joint Congress 2024（IUPAB 2024）,27P-063, 2024/06/27

〇Shiho Aoki, Wataru Onodera, Toru Asahi, 'Protein Evolution Analysis by Molecular Dynamics Simulation of Intrinsically Disordered Proteins', YBS2023, Student Challenge, 2023

受賞歴

留学

その他

【資格】
書道 師範部準四段 （2017）
認定スクラムマスター（Certified ScrumMaster®：CSM®）取得（2021.07）
NSSOL Capture The Flag（CTF） 4位入賞（2021.08）
IPA 情報セキュリティマネジメント試験 合格（2021.12）