青木 志穂 Shiho Aoki B.Sc.
一貫制博士3年(博士1年相当)
先進理工学専攻 (5年一貫制博士課程)12期生
中谷医工計測技術振興財団 大学院生奨学金 7期生(2023年~2028年)
日本学術振興会特別研究員 (DC1)
【研究開発支援制度】
サイボウズ・ラボユース第13期 研究生(2023年度)
サイボウズ・ラボユース第14期 ユース生(2024年度)
k1973olly@akane.waseda.jp
GitHub: @shiho-aoki
学歴2019年 早稲田大学本庄高等学院 卒業
2019年 早稲田大学先進理工学部生命医科学科 入学
2023年 早稲田大学先進理工学部生命医科学科 卒業
2023年 早稲田大学院先進理工学研究科 先進理工学専攻 入学
生物班
研究テーマE3ユビキチンリガーゼPraja Familyを通したタウタンパク質の品質管理・分子病態制御
分子進化, E3ユビキチンリガーゼ, アルツハイマー病, 分子動力学シミュレーション(MD), 量子アニーリング
所属学会日本分子生物学会, 日本生物物理学会, 日本蛋白質科学会, 生化学会
論文[4] E3 ligase Praja1 mediates ubiquitination and degradation of microtubule-associated protein Tau,
Shiho Aoki, Kotaro Kawasaki, Kazuki Imadegawa, Mizuho Oishi, Toru Asahi, Wataru Onodera, bioRxiv. (2024).
[3] Functional Divergence and Origin of the Vertebrate Praja Family,
Wataru Onodera, Kotaro Kawasaki, Mizuho Oishi, Shiho Aoki, Toru Asahi, J Mol Evol. (2024).
[2] Data on the solution and processing time reached when constructing a phylogenetic tree using a quantum-inspired computer,
Wataru Onodera, Nobuyuki Hara, Shiho Aoki, Toru Asahi, Naoya Sawamura, Data in Brief, 47, 108970 (2023).
[1] Phylogenetic tree reconstruction via graph cut presented using a quantum-inspired computer,
Wataru Onodera, Nobuyuki Hara, Shiho Aoki, Toru Asahi, Naoya Sawamura, MOL PHYLOGENET EVOL., 178, (2023).
[1] 2025–2027年度 日本学術振興会特別研究員奨励費 (DC1)
【国内学会発表】
○青木 志穂, 川﨑 晃太郎, Imadegawa Kazuki, 大石 瑞穂, 内田 智也, 加藤 尚己, 櫻木 繁雄, 坂内 博子, 朝日 透, 小野寺 航,
【ポスター】E3ユビキチンリガーゼPraja1による微小管関連タンパク質タウの分解・品質管理機構の解析, 第47回 日本分子生物学会年会, 2P-367, 2024/11/28
〇青木志穂, 川﨑晃太郎, Imadegawa Kazuki, 大石瑞穂, 朝日透, 小野寺航,
【ポスター】E3リガーゼPraja1は微小管関連タンパク質タウのユビキチン化と分解を促す, 第97回日本生化学会大会, 1P-202, 2024/11/06
⚪︎Shiho Aoki, Kotaro Kawasaki, Wang Chen, Mizuho Oishi, Toru Asahi, Wataru Onodera,
【口頭】'E3 ligase praja1 mediates ubiquitination and degradation of Microtubule-associated protein Tau', タウ研究会2024, 2024/08/23
〇Shiho Aoki, Toru Asahi, Wataru Onodera,
【ポスター】'Comprehensive Analysis of the Properties and Functions of Intrinsically Disordered Proteins (IDP) by Integrated Database Profiling', 第24回日本蛋白質科学会, 1P-067, 2024/06/11
〇Shiho Aoki, Wataru Onodera, Toru Asahi,
【ポスター】'Functional analysis of a low-complexity region specific to the primate E3 ubiquitin ligase Praja1.', The 46th Annual Meeting of the Molecular Biology Society of Japan (MBSJ2023),1P-334, 2023/12/06
〇Shiho Aoki, Wararu Mori, Toru Asahi, Wataru Onodera,
【ポスター】'Analysis of a low-complexity region, a naturally degenerate region specific to the primate E3 ubiquitin ligase Praja1.' Supercomputer Workshop 2023, P-2, 2024/01/15
【国際学会発表】
〇Shiho Aoki, Toru Asahi, Wataru Onodera,
【ポスター】'Comprehensive Analysis of Intrinsically Disordered Proteins in the Marsupial.' 21st IUPAB & 62nd BSJ Joint Congress 2024(IUPAB 2024),27P-063, 2024/06/27
〇Shiho Aoki, Wataru Onodera, Toru Asahi, 'Protein Evolution Analysis by Molecular Dynamics Simulation of Intrinsically Disordered Proteins', YBS2023, Student Challenge, 2023
【資格】
書道 師範部準四段 (2017)
認定スクラムマスター(Certified ScrumMaster®:CSM®)取得(2021.07)
NSSOL Capture The Flag(CTF) 4位入賞(2021.08)
IPA 情報セキュリティマネジメント試験 合格(2021.12)